Assassin's Creed Shadows consente ai giocatori di scegliere tra due protagonisti: Naoe, uno shinobi femminile e Yasuke, un samurai africano storico. Questa scelta ha generato una discussione tra i fan preoccupati per i contenuti potenzialmente mancanti concentrandosi su un singolo personaggio.
Il direttore creativo Jonathan Dumont assicura ai giocatori che la priorità di un protagonista non porterà a contenuti mancati significativi. Mentre ogni personaggio presenta sequenze di apertura uniche e archi di storie personali, la narrativa del gioco si adatta alla scelta del giocatore. Lo stesso Dumont gioca il gioco con un approccio equilibrato, passando da Naoe e Yasuke ogni poche ore. Tuttavia, sottolinea che i giocatori sono liberi di concentrarsi sul loro personaggio preferito senza paura di perdere elementi di storia cruciale o esperienze di gioco. Il gameplay e la narrazione di base rimangono accessibili indipendentemente dal protagonista scelto. Incoraggia i giocatori a giocare semplicemente nel modo in cui si divertono di più.
